El edificio sede de la Santa Casa de la Misericordia de Lourinhã, fundada por un edicto de Felipe II fechado el 23 de julio de 1586, está constituido por tres construcciones distintas, de tres épocas y estilos diferentes que no lo privan de una unidad bastante armoniosa.

En el centro del edificio se alza la iglesia, con la fecha de 1626 inscrita en el tímpano. Es un templo de características renacentistas, de una sola nave, de techo con artesonado y paredes estucadas. El retablo del altar mayor es ya del siglo XVIII, así como la tribuna de los cofrades y la capilla del Señor de los Pasos, en talla dorada barroca.
Al este de la iglesia encontramos la parte más antigua, que perteneció a la capilla del Santo Espíritu, del siglo XVI, con un notable portal manuelino.

Al oeste se alza el Hospital, del siglo XVIII, en cuya fachada se abre la puerta principal sobre la que figura el escudo de don João V, en piedra calcárea blanca.

Pero el interés de la Santa Casa de la Misericordia consiste también en su rico patrimonio museológico, en el que destaca la colección de pintura del siglo XVI. Aquí podemos admirar los dos cuadros atribuidos al Maestro de Lourinhã: San Juan Bautista en la isla de Patmos y San Juan Bautista en meditación. Son de inspiración flamenca y están considerados muestras de la mejor pintura de la época en nuestro país. Destacan también las obras de Lourenço de Salzedo, pintor manierista, de origen castellano, constituidas por cuatro tablas de mucho valor, sobre todo la de San Jerónimo. También se pueden admirar tres cuadros, atribuidos al pintor Francisco de Campos, además de un estandarte de la Misericordia de Diogo Teixeira, en tela.